Председатель Думы Пограничного муниципального округа избирается из числа ее депутатов на срок полномочий Думы на ее первом заседании после избрания нового состава депутатов или в случае досрочного прекращения полномочий ранее избранного председателя Думы.
Порядок избрания председателя Думы Пограничного муниципального округа определяется Регламентом Думы Пограничного муниципального округа.

Председатель Думы:
1) организует работу Думы и представляет ее в отношениях с жителями муниципального округа, органами и должностными лицами государственной власти и местного самоуправления, иными организациями и гражданами;
2) руководит подготовкой заседаний Думы, созывает заседания Думы, доводит до сведения депутатов Думы время и место его проведения, а также повестку дня;
3) оказывает содействие депутатам Думы и комиссиям Думы в осуществлении ими своих полномочий, координирует их работу;
4) руководит работой аппарата Думы;
5) организует работу с обращениями населения Пограничного муниципального округа по вопросам деятельности Думы;
Председатель Думы осуществляет свои полномочия в Думе на постоянной основе. Он подотчетен и подконтролен Думе в своей работе.